沪通铁路的路线走向连接上海（沪）—江苏省南通。江苏境内7站已敲定，预留常熟东沪通铁路（沪通快铁）已敲定的有9个站，江苏境内分别是平东站、南通西站、张家港北站、张家港站、常熟站、太仓港站、太仓站等7个站，上海境内有安亭、黄渡2个站。这其中，由于沪通铁路与规划中的沿江城际铁路共用张家港至安亭部分，所以在常熟还为沿江城际预留了常熟东站。另外，太仓市也在争取再多设一个太仓南站。最终的站点设置要待项目初步设计完成后才能出来。
