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blast什么意思? 抗生素有哪些

2023-04-16 01:32:47 互联网 未知 健康

 blast什么意思? 抗生素有哪些

blast什么意思?

BLAST (Basic Local Alignment Search Tool)是一套在蛋白质数据库或DNA数据库中进行相似性比较的分析工具。BLAST程序能迅速与公开数据库进行相似性序列比较。BLAST结果中的得分是对一种对相似性的统计说明。

BLAST 采用一种局部的算法获得两个序列中具有相似性的序列。如果您想进一步了解BLAST算法,您可以参考NCBI的BLAST Course ,该页有BLAST算法的介绍。

BLAST功能是什么?

BLAST对一条或多条序列(可以是任何形式的序列)在一个或多个核酸或蛋白序列库中进行比对。BLAST还能发现具有缺口的能比对上的序列。

BLAST是基于Altschul等人在J.Mol.Biol上发表的方法(J.Mol.Biol.215:403-410(1990)),在序列数据库中对查询序列进行同源性比对工作。从最初的BLAST发展到现在NCBI提供的BLAST2.0,已将有缺口的比对 序列也考虑在内了。BLAST可处理任何数量的序列,包括蛋白序列和核算序列也可选择多个数据库但数据库必须是同一类型的,即要么都是蛋白数据库要么都是核酸数据库。所查询的序列和调用的数据库则可 以是任何形式的组合,既可以是核酸序列到蛋白库中作查询,也可以是蛋白序列到蛋白库中作查询,反之亦然。

GCG及EMBOSS等软件包中包含有五种BLAST:

1、BLASTP是蛋白序列到蛋白库中的一种查询。库中存在的每条已知序列将逐一地同每条所查序列作一对一的序列比对。

2、BLASTX是核酸序列到蛋白库中的一种查询。先将核酸序列翻译成蛋白序列(一条核酸序列会被翻译成可能的六条蛋白),再对每一条作一对一的蛋白序列比对。

3、BLASTN是核酸序列到核酸库中的一种查询。库中存在的每条已知序列都将同所查序列作一对一地核酸序列比对。

4、TBLASTN是蛋白序列到核酸库中的一种查询。与BLASTX相反,它是将库中的核酸序列翻译成蛋白序列,再同所查序列作蛋白与蛋白的比对。

5、TBLASTX是核酸序列到核酸库中的一种查询。此种查询将库中的核酸序列和所查的核酸序列都翻译成蛋白(每条核酸序列会产生6条可能的蛋白序列),这样每次比对会产生36种比对阵列。由于这种比对? 母丛有裕

抗生素有哪些

抗生素有:β-内酰胺类抗生素:青霉素及半合成青霉素类(青霉素G,青霉素V,甲氧西林,氨苄西林,苯唑西林,双氯西林,氟氯西林等)、头孢菌素(头孢氨苄,头孢拉定,头孢噻吩,头孢曲松,头孢匹罗,头孢克肟,头孢托仑酯,头孢地尼,头孢丁烯头孢帕肟酯等等)、单环β-内酰胺(氨曲南)、头霉素类(头孢米诺钠等)、碳青霉烯类(比安培南、亚胺培南、美罗培南等) 大环内酯类:红霉素、罗红霉素、琥乙红霉素、克拉霉素、螺旋霉素、麦白霉素、麦迪霉素、阿奇霉素、泰利霉素等 喹诺酮类:环丙沙星、左氧氟沙星、诺氟沙星等 氨基糖苷类:链霉素、庆大霉素、卡那霉素、阿贝卡星等。 氯霉素类:氯霉素、甲砜霉素、无味氯霉素等 糖肽类:万古霉素、替考拉宁、磷霉素 异恶唑类:利奈唑胺 脂肽类:达托霉素 磺胺类:新诺明、复方新诺明 另有抗真菌的抗生素:两性霉素等 抗病毒的抗生素:阿昔洛韦等

抗生素有那些?

氨基糖甙类:包括链霉素、丁胺卡那霉素、卡那霉素、妥布霉素、庆大霉素、新霉素、核糖霉素、小诺霉素、阿斯霉素等。
  (三)四环素类:包括土霉素、四环素、金霉素及强力霉素等。
  (四)氯霉素类:包括氯霉素、甲砜霉素等。
  (五)大环内脂类:临床常用的有红霉素、白霉素、无味红霉素、乙酰螺旋霉素、麦迪霉素、交沙霉素等。
  (六)作用于G 细菌的其它抗生素,如林可霉素、万古霉素、氯林可霉素、杆菌肽等。
  (七)作用于G菌的其它抗生素,如磷霉素、多粘菌素、卷霉素、环丝氨酸、利福平等。
  (八)抗真菌抗生素:如灰黄霉素。
  (九)抗肿瘤抗生素:如丝裂霉素、放线菌素D、博莱霉素、阿霉素等。
  (十)具有免疫抑制作用的抗生素如环孢霉素。